NED365343NED

102 d 1 = d 2 = ½ ln (1 + 2 √ s ), где s — доля отобранных ВС 1 особей. Этот подход, который основыва- ется на допущении бесконечного размера популяции и ее оптимальных свойствах, только тогда будет верным, если два маркера на несущей хромосоме целевого гена будут использованы безошибочно. Альтернативный метод расчета d 1 и d 2 основывается на предпо- ложении (или логическом обосновании), что в популяции с данным размером n как минимум одно- или двурекомбинантная особь будет найдена с вероятностью q (Frisch et al. 1999b). Для определения n веро- ятности q , приведенные в таблице 5.1, вносят в формулу p = 1– (l — q ) 1/ n и полученное уравнение решают соответственно для d 1 и d 2 (Frisch et al. 1999b). Позиции маркеров, использованных для фоновой селекции на не- несущих хромосомах, могут быть определены так, что корреляция меж- ду молекулярным маркером, оценивающим содержание донорного ге- нома, и истинным содержанием донорного генома будет максимизиро- вано (Visscher, 1996). В этом подходе дистанция между теломерой и первым маркером была определена числовыми сравнениями альтер- нативных позиций на карте для того, чтобы оптимизировать корреляции. Для оставшихся маркеров Visscher (1996) показал, что максимальная корреляция может быть достигнута, если эти маркеры распределены равномерно. Оптимум дистанции между теломерой и первым маркером различается для каждого беккроссного поколения, что делает затрудни- тельным выбор маркерной дистанции для беккроссных программ с по- колениями, являющимися результатом фоновой селекции. Подход, который принимает в расчет отбор на протяжении не- скольких поколений, был представлен Servin и Hospital (2002). Они предложили отбор позиций маркеров так, что после фиксирования всех маркеров для рекуррентного родительского аллеля, ожидаемое (вероят- ное) содержание донорного родительского генома на хромосоме макси- мизируется. Так же как и в подходе Visscher (1996), дистанция между теломерой и первым маркером определяется численной оценкой, при- ближенным вычислением и равномерным распределением оставшихся маркеров. 5.5. Стратегии отбора Рассмотрим маркер-вспомогательную беккроссную программу, состоящую из s = 1... t поколений, где были использованы всего n = n 1 + ... + n t растений, и размер популяции n s на поколение является зна-